La Dirección General de Intereses Marítimos se creó como un organismo técnico administrativo, subordinado a la Comandancia General de Marina, mediante Decreto LeyNo. 1857, del 23 de Septiembre de 1977, publicado en el Registro Oficial No. 434 del 30 de los mismos mes y año, estableciéndose en su artículo 2 que cuenta con personería jurídica, patrimonio propio y domicilio en la ciudad de Quito.

En Febrero del 2001 la DIGEIM deja de ser un gran reparto de desarrollo y pasa a ser un órgano de asesoramiento del Comandante General de Marina, desprendiéndose del INOCAR, SERDRA, INHIMA y de la DIRECCIÓN DE EMPRESAS. Posteriormente en Enero del 2002 el INHIMA regresa bajo jurisdicción de la DIGEIM.

Con fecha 22 de Julio del 2002, el señor Comandante General de Marina, comunica a DIGEIM, que el sector de Intereses Marítimos ha sido reestructurado, otorgándole la calidad de Gran Reparto, como un órgano de desarrollo.

Esta Dirección otorga el asesoramiento al más alto nivel que contribuye a la proyección de los Intereses Marítimos del país hacia las cuencas del Pacífico, Atlántico y región Antártica, con sistemas integrados a la Región y así promover el fortalecimiento de los elementos de desarrollo, control e investigación marítima.

Sus repartos subordinados son:

• Instituto Oceanográfico de la Armada (INOCAR)
• Instituto de Historia Marítima (INHIMA)
• Servicio de Dragas (SERDRA)